在填报提交后三天即可生效。成功填报的专项附加扣除信息，若填报时指定由某扣缴单位申报的，该扣缴单位可在纳税人提交的第三天后通过扣缴客户端的“下载更新”功能下载到纳税人所填报的信息，纳税人无需再向扣缴单位另行填报。

先给出结论：两者殊途同归，最终结果是一模一样的。

举个简单的例子。例如你一年收入12w，免税额度是6w（5000/月）。你单独赡养两位老人（2000/月）的抵扣额度。

首先我们来计算下你最终需要交税的额度为多少？我们知道交税额度=12w-6w-0.2*12w=3.6w。交税比例正好为3%。

因此无论你选择通过扣缴义务人申报还是综合所得年度自行申报，你一年所需要交的税为3.6w*0.03=1080元。

不同的是，如果你选择“通过扣缴义务人申报”，此时你单独赡养一位老人（2000/月）的额度将平摊到每个月，也就是说你每个月的免税额度提高了2000/月，从原来的5000/月提高到7000元美元。此时每月交税额度为3000元，按照3%的交税比例为90元。12个月正好缴存了1080，年终你就无需退税。

如果你选择“综合所得年度自行申报”。那么你每个月你单位胶水过程中不会考虑你的抵扣项。此时，每个月你工资10000元，免税额度为5000元。应该交税额度为5000元，按3%计算的话每月交税额度为150元（此处简化了计算，例如第8个月之后累计交税额度超过36000，交税比例为10%，有兴趣的可以看下一篇笔记）。因此，你当年度交税一共一共为1500*12=1800元。因此，当你进行综合所得年度自行申报之后，算上你每个月2000/元赡养老人的免税额度，系统发现多给你扣了税。因此就有了需要给你退的税，退税金额=1800-1080=720元。

纳税人未及时确认的，扣缴义务人于次年1月起暂停扣除，待纳税人确认后再行办理专项附加扣除。若未及时确认，前期已填报的扣除信息将自动视同有效并延长至次年。也就是说，未及时填报当年度个税专项附加扣除信息将会直接顺延至次年。